More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3666 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  99.24 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  78.03 
 
 		 132 aa  222  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  76.52 
 
 		 132 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  64.39 
 
 		 132 aa  184  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  47.29 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  43.27 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  43.44 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  40.32 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  34.88 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  37.3 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.9 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  32.08 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  35.29 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  43.82 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.74 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  37.96 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  37.96 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  35.2 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  35.51 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  35.51 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  42.53 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  35.51 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  35.51 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  31.71 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  35.51 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  35.51 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  33.9 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  40.7 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.85 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  37.74 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  37.74 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  37.74 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  37.74 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  34.19 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  37.74 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  37.74 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>