More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0390 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
130 aa  266  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  39.02 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
146 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
146 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  40 
 
 
142 aa  83.6  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  40 
 
 
142 aa  83.6  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
137 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  38.83 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  40.2 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  40.2 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  40.2 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  40.2 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  40.2 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  40.2 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  40.2 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  37.74 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  35.92 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  35.92 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  35.92 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  35.92 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.6 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  35.92 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  35.92 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  37.74 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  34.17 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  31.2 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  35.29 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
117 aa  70.1  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  30.77 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  37.74 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  31.53 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.43 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  31.37 
 
 
260 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  34.29 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  32.38 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  27.62 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  31.15 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  30.56 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  34.95 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  29.57 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  29.52 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  28.3 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  27.87 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  30.93 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  26.42 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>