More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1262 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
136 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
136 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  98.53 
 
 
136 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  91.18 
 
 
136 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  80.77 
 
 
139 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  73.72 
 
 
137 aa  159  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  78.26 
 
 
138 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  57.58 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  56.82 
 
 
135 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  56.06 
 
 
135 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  56 
 
 
139 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  53.57 
 
 
142 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  53.57 
 
 
142 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 
139 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  55.3 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  66.99 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  66.99 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  55.56 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  66.99 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  66.99 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  66.99 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  66.99 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  66.99 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  58.12 
 
 
141 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  60.75 
 
 
146 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  60.75 
 
 
146 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 
137 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  53.03 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  53.03 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  53.03 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  53.03 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  53.03 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  53.03 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  52.14 
 
 
127 aa  123  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  55.86 
 
 
135 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  52.59 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  51.4 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  45.3 
 
 
195 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 
139 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  52.76 
 
 
137 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  41.51 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 
130 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  39.68 
 
 
130 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  41.32 
 
 
132 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.96 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  37.96 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.53 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  37.38 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
173 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  35.19 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  31.86 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.83 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  37.17 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  31.97 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  30.33 
 
 
195 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.19 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  25.58 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>