More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3461 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
122 aa  246  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  48.76 
 
 
120 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  53.45 
 
 
117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  52.63 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  50.41 
 
 
121 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  40 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  40 
 
 
134 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
185 aa  83.6  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  35.24 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  34.23 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  34.23 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  35.24 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  35.24 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  34.62 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  37.14 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
195 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  35.29 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.65 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  34.19 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  31.62 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  33.93 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  38.79 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.78 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
158 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
158 aa  67  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.78 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.08 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.08 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.54 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  34.26 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.9 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  31.78 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.61 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  28.04 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  27.62 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  31.78 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>