More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6420 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
146 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
146 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  97.87 
 
 
141 aa  276  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  65.22 
 
 
139 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  64.49 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  68.31 
 
 
162 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  63.38 
 
 
142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  63.38 
 
 
142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  68.09 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  68.09 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  68.09 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  68.09 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  67.38 
 
 
139 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  67.38 
 
 
139 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  66.67 
 
 
135 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  59.69 
 
 
135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  58.91 
 
 
135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  58.46 
 
 
131 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  66.35 
 
 
135 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  53.9 
 
 
137 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  57.94 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  57.94 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  58.7 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  57.14 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  57.14 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  57.14 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  57.14 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  65.45 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  56.52 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  65.42 
 
 
138 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  64.49 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  65.42 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  49.6 
 
 
127 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  51.85 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  60.75 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  60.75 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
139 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  60.95 
 
 
136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  47.2 
 
 
195 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  42.5 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  44.86 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
130 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  39.05 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  37.38 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  35.24 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  35.51 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  36.19 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  32.71 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  36.36 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.01 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  36.7 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5732  hypothetical protein  57.58 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34005  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  33.33 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  29.92 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>