More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7807 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  100 
 
 
127 aa  259  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  45.22 
 
 
132 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  43.1 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  42.37 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  40 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  37.04 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  37.04 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  36.7 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  37.29 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  33.6 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.65 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  33.07 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.65 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  30.89 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.71 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  35.29 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  35.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  33.33 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  28.93 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  34.17 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  33.91 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  30.89 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.71 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.58 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.82 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.58 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  32.32 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  33.66 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  33.66 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  36.45 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  33.66 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  31.01 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  33.66 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  33.66 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>