More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4157 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  69.63 
 
 
147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  59.33 
 
 
149 aa  193  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  58.67 
 
 
149 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  58.67 
 
 
149 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  58.67 
 
 
149 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  57.33 
 
 
149 aa  186  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  57.04 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  51.33 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  44.29 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
140 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 
144 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  43.61 
 
 
147 aa  110  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
163 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
143 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  41.55 
 
 
142 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
165 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  37.42 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.71 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  41.61 
 
 
144 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  38.41 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
146 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  37.41 
 
 
147 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 
147 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.81 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.81 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  35.17 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  39.62 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  34.75 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  34.75 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  34.75 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  34.78 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  34.75 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  34.78 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  34.75 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  34.75 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  31.03 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  32.05 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  28.77 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  34.31 
 
 
215 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  36.89 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  40.2 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>