More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2398 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  100 
 
 
147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  85.03 
 
 
146 aa  256  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  72.11 
 
 
146 aa  223  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  71.43 
 
 
146 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  70.07 
 
 
146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  70.07 
 
 
146 aa  215  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  70.07 
 
 
146 aa  215  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  67.35 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  67.35 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  67.35 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  67.35 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  67.35 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  67.35 
 
 
215 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  67.35 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  68.71 
 
 
146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  70.95 
 
 
145 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  63.27 
 
 
147 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  68.24 
 
 
145 aa  205  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  66.67 
 
 
147 aa  205  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  66.67 
 
 
147 aa  205  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 
147 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 
147 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  63.95 
 
 
146 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  62.59 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  62.59 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  62.59 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  62.59 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  62.59 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  62.59 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  60.54 
 
 
146 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 
146 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  58.5 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  58.5 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  58.5 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  58.5 
 
 
146 aa  176  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 
146 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  71.56 
 
 
118 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  49.32 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  46.53 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  47.14 
 
 
157 aa  124  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 
146 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  36.24 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
150 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
141 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.78 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  31.79 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  29.45 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  30.41 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  40.57 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  29.37 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.62 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  35.85 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.5 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.5 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  31.47 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  29.2 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>