More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2580 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  72.6 
 
 
146 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  72.6 
 
 
146 aa  216  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  68.28 
 
 
215 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  68.28 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  68.28 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  68.28 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  68.28 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  68.28 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  68.28 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  70.95 
 
 
147 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  68.49 
 
 
146 aa  207  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  67.81 
 
 
146 aa  203  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  66.44 
 
 
146 aa  200  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  66.22 
 
 
147 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  66.22 
 
 
147 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  66.44 
 
 
146 aa  198  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  65.07 
 
 
146 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  65.07 
 
 
146 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  65.07 
 
 
146 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  64.63 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  64.38 
 
 
146 aa  194  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  66.44 
 
 
145 aa  193  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  64.38 
 
 
146 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  63.7 
 
 
146 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  61.49 
 
 
147 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  60.81 
 
 
147 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  60.81 
 
 
147 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  59.59 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  59.59 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  59.59 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  59.59 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  59.59 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  63.01 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  63.01 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  59.59 
 
 
146 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  71.56 
 
 
118 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  50.34 
 
 
149 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  49.64 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  46.81 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  46.9 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  39.86 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  34.72 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  37.7 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.94 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  28.91 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.57 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.35 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.13 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  29.13 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>