More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3375 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 146 aa  293  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  66.9 
 
 		 145 aa  220  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  51.33 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  49.33 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  47.83 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  46.36 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 		 146 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  46.1 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  42.55 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  42.55 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  46.38 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  43.26 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  42.25 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  44.68 
 
 		 145 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  44.68 
 
 		 145 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  44.68 
 
 		 145 aa  121  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  44.68 
 
 		 145 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  44.68 
 
 		 145 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  44.68 
 
 		 145 aa  121  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  44.68 
 
 		 215 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  44.06 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  40.43 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 		 146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  43.24 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  28.48 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  38.1 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  30.46 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  44.94 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.81 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.32 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 		 164 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>