More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1730 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  100 
 
 		 149 aa  296  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  52.67 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  53.64 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  51.33 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  51.7 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  51.7 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  53.06 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  53.06 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  53.06 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  54.55 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  50.34 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  49.66 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  49.66 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  49.66 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  49.66 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  49.66 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  49.66 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  49.32 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 215 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  48.61 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  50.34 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  48.95 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  48.95 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  50.69 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  48.3 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  44.22 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  44.22 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  50.93 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  37.93 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  38 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.52 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.35 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  37.09 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.72 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.72 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.06 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  29.01 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>