More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2410 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  100 
 
 		 149 aa  303  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  89.93 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  81.21 
 
 		 148 aa  258  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  80.54 
 
 		 148 aa  258  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  75.84 
 
 		 149 aa  239  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  47.97 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  39.74 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  37.93 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  36.73 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  30.61 
 
 		 157 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  34.72 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 		 164 aa  84  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 215 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.65 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.68 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  33.33 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  33.33 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  33.79 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  28.48 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  38.61 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  32.88 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  32.88 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  32.88 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  31.79 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  32.88 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  32.88 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  32.17 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  32.88 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2299  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.6 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.25 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>