More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7806 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  100 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.81 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
152 aa  87  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.88 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  36.54 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  34.53 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  34.53 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  34.53 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  34.53 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  34.53 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  34.53 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  32.17 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  31.85 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.85 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  30.2 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  30.66 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  37.84 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  29.71 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  29.71 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  32.74 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  29.53 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  28.67 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  30.77 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
197 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>