More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2958 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  290  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  69.12 
 
 
136 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  57.46 
 
 
135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  52.94 
 
 
137 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  47.45 
 
 
137 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  42.34 
 
 
137 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  43.48 
 
 
138 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.77 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
147 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  42.72 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
153 aa  84  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
149 aa  84  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  36.81 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  36.81 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  36.81 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  36.81 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  36.81 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.56 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  36.81 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  36.81 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  41.23 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  37.24 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  40.8 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.59 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  40 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  35.66 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  35.66 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  41.44 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
143 aa  76.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  35.34 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  32.19 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.78 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  34.33 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  36.75 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  37.96 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1230  heat shock protein Hsp20  30.33 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  42.06 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.62 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.62 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  29.29 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  31.16 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  31.16 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  31.16 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  31.16 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  31.16 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  31.16 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>