More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3092 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  100 
 
 
138 aa  280  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  62.32 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  63.04 
 
 
137 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  45.32 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  47.41 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
142 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
137 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
152 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.57 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  35.58 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  33.65 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  31.11 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  31.62 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  35.78 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  33.09 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  38.79 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  32.03 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
172 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  31.65 
 
 
149 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
146 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  25.95 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
173 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  31.16 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  31.16 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.69 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  31.16 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  31.16 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  28.24 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  31.16 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  31.16 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  31.16 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  26.81 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  31.4 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  33.06 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.39 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  32.58 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  32.58 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  29.32 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  33.58 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>