More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1354 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
134 aa  270  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2207  heat shock protein Hsp20  58.14 
 
 
129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.540832  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0859  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.340245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
148 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
148 aa  77  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.06 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  38.14 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.14 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  31.15 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  29.05 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  32.26 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  29.8 
 
 
197 aa  63.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.88 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  32.46 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  33.98 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
195 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
189 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
218 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  29.6 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
189 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
191 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  27.82 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
185 aa  60.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
189 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
174 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  28.44 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.68 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.1 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.96 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.5 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.03 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  29.85 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  28.42 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  32.33 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  29.6 
 
 
151 aa  57.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  27.27 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  32.69 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2181  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
203 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  30.39 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  27.61 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>