More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2181 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2181  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  32.24 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.04 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.04 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  26.98 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  26.98 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.46 
 
 
144 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
139 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  35.58 
 
 
160 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.74 
 
 
147 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
160 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.52 
 
 
146 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
147 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
149 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
151 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.62 
 
 
147 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  33.7 
 
 
141 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  35.64 
 
 
158 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
147 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
142 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
156 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  27.4 
 
 
144 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  27.1 
 
 
147 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  26.71 
 
 
144 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
134 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  25.11 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  29.82 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  31.73 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
139 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.58 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
139 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  32.08 
 
 
152 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
142 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  29.7 
 
 
148 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  29.41 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  31.68 
 
 
154 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
153 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
178 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.12 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  28.12 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
143 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  28.26 
 
 
139 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  26.28 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  26.77 
 
 
131 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  27.36 
 
 
142 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  29.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  29.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  27.43 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  29.36 
 
 
141 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  29.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
148 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  29.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  29.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  30.28 
 
 
513 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  27.48 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  29.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
149 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
138 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0344  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
141 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 
143 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1166  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
81 aa  52  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.380039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>