More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2281 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
173 aa  357  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
184 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.26 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  43.24 
 
 
152 aa  95.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 
150 aa  91.7  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
176 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  33.57 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
189 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
166 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.84 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  36.11 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  29.49 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.96 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.96 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.14 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.17 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.17 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  32.84 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.38 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  37.96 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.44 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  32.93 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.74 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.58 
 
 
162 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.35 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  37.96 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  35.19 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  30.63 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
105 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.52 
 
 
142 aa  77  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  32.85 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  31.43 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  29.87 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  36.28 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>