More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0623 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 152 aa  310  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2294  hypothetical protein  97.5 
 
 		 97 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0992977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1166  heat shock protein Hsp20  98.77 
 
 		 81 aa  163  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.380039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2299  heat shock protein Hsp20  97.26 
 
 		 73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  47.68 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1167  hypothetical protein  95.38 
 
 		 79 aa  133  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.294182  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  51.01 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  51.01 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  41.72 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  41.72 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  43.71 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  44.16 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  43.51 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  39.6 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  42.38 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  41.72 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  40.56 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.27 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.54 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.58 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  39.55 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  39.04 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.93 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  40.16 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.3 
 
 		 260 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.67 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  39.74 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  39.74 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 147 aa  94.4  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  39.17 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  39.17 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  45.28 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.43 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  46.15 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  32.43 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 		 139 aa  84.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 189 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  41.07 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  30.52 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  44.66 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  34.25 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>