More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1742 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
152 aa  306  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  46.84 
 
 
151 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  46.27 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  41.98 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  46.27 
 
 
147 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  43.08 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
137 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  41.22 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
194 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  40.88 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  41.22 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.69 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
149 aa  94  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
142 aa  92  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  39.26 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  39.01 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.53 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.53 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.28 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  38.57 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.84 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.84 
 
 
144 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
176 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 
204 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  34.85 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
189 aa  87.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
139 aa  87.4  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 
158 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  35.61 
 
 
138 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
148 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  35.71 
 
 
146 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
184 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
141 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.11 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.82 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.82 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
180 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
144 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
230 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
189 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
189 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
164 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  34.59 
 
 
146 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  34.59 
 
 
146 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  34.59 
 
 
146 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  36.09 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  34.59 
 
 
146 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  34.59 
 
 
146 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  34.59 
 
 
146 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  37.12 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  37.12 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  37.12 
 
 
215 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  37.12 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  36.09 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  36.09 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  37.12 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  37.12 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  37.12 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  35.26 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  40.48 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  39.1 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  30.83 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>