More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2532 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  66.2 
 
 
144 aa  203  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  62.41 
 
 
143 aa  186  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  62.94 
 
 
143 aa  183  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  64.83 
 
 
139 aa  182  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  54.11 
 
 
148 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
160 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  49.66 
 
 
160 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  52.99 
 
 
158 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
150 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  46.41 
 
 
156 aa  140  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  44.29 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  44.29 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  42.14 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  43.61 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
151 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  42.14 
 
 
145 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  42.14 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.93 
 
 
147 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
145 aa  106  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 
146 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 
149 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
147 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  36.18 
 
 
145 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
147 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  44.86 
 
 
150 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
152 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
147 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
153 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
147 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
149 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
189 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
163 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
195 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
141 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
150 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.92 
 
 
189 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
176 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
189 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.67 
 
 
186 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
189 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  35.67 
 
 
231 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
189 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  32.85 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  41.24 
 
 
139 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
152 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.51 
 
 
162 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.57 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  40 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.37 
 
 
176 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
184 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
177 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
230 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  42.55 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  35.21 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  38.52 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  40.95 
 
 
134 aa  84.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
147 aa  84.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 
164 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  35.88 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  42.57 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  41.84 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  40.82 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>