More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3234 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  96.24 
 
 		 186 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  54.02 
 
 		 177 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  47.57 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  46.7 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  50.54 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  43.78 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  43.78 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  44.68 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  47.31 
 
 		 173 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  46.02 
 
 		 177 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  40.49 
 
 		 177 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 166 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  40.83 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40.26 
 
 		 156 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  40.23 
 
 		 189 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  39.24 
 
 		 147 aa  101  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  40.24 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 142 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  39.66 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  39.08 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 		 147 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 		 158 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 		 165 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 		 147 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  55.21 
 
 		 145 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  47.06 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  36.42 
 
 		 169 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 162 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  46.88 
 
 		 147 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  54.17 
 
 		 145 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  40.51 
 
 		 145 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 147 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  35.84 
 
 		 173 aa  95.1  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 		 149 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  39.73 
 
 		 153 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 		 166 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  53.12 
 
 		 145 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  38.56 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 		 156 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 		 167 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 		 169 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  49.02 
 
 		 143 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  46.88 
 
 		 147 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 		 185 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 		 185 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 172 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  35.06 
 
 		 163 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  42.45 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 		 150 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.67 
 
 		 144 aa  89.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  38.56 
 
 		 168 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 		 105 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  37.18 
 
 		 167 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.34 
 
 		 166 aa  88.6  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  39.09 
 
 		 162 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  42.86 
 
 		 151 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  36.2 
 
 		 158 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 		 143 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  36.31 
 
 		 162 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  42.98 
 
 		 158 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 		 158 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 		 142 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  39.09 
 
 		 162 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 150 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 158 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 		 143 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 		 166 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 		 134 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 		 139 aa  85.1  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 		 169 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  43.56 
 
 		 145 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.74 
 
 		 141 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  45.65 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  30.82 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  43.69 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  32.34 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 173 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  31.45 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  32 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>