More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2118 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  60.61 
 
 
166 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  60.61 
 
 
166 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  61.08 
 
 
169 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  54.76 
 
 
168 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  60.36 
 
 
167 aa  190  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  59.04 
 
 
168 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  55.15 
 
 
166 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  60.95 
 
 
165 aa  184  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  58.08 
 
 
169 aa  183  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  56.55 
 
 
172 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  53.94 
 
 
167 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  55.03 
 
 
171 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  51.83 
 
 
162 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  55.03 
 
 
185 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  55.03 
 
 
185 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  53.71 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 
166 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  48.5 
 
 
164 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  46.11 
 
 
164 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 
194 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 
204 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.41 
 
 
163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
189 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
189 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36.7 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
189 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
176 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  39.55 
 
 
180 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  39.77 
 
 
181 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  39.77 
 
 
181 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  42.94 
 
 
175 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  43.33 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  34.94 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  33.14 
 
 
166 aa  94.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37.18 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  37.27 
 
 
231 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.5 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.66 
 
 
176 aa  90.5  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  38.97 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
146 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 
166 aa  87.8  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
147 aa  87.8  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  33.53 
 
 
158 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  33.53 
 
 
158 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
158 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.17 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.09 
 
 
198 aa  85.1  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
218 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
180 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.46 
 
 
164 aa  84  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  35.12 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  32.97 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  32.97 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  35.71 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
145 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.06 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  41.05 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  31.73 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  39.18 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  37.34 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  41.05 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7808  Hsp20 family heat-shock protein  44.57 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00255696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  30.64 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  39.36 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  39.36 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.2 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>