More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1127 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  276  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  55.94 
 
 
142 aa  165  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  55.32 
 
 
147 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  53.9 
 
 
147 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
156 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.79 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
146 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
146 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  46.34 
 
 
139 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
169 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
173 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  50.44 
 
 
151 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  44.37 
 
 
173 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.85 
 
 
143 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
162 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
145 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
145 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
148 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
144 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  47.75 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  38.85 
 
 
198 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  48.65 
 
 
149 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 
147 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
185 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
185 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  45.95 
 
 
147 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  41.94 
 
 
231 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
204 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
145 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 
169 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
172 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  41.29 
 
 
186 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  40.85 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 
189 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  41.3 
 
 
146 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
145 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.82 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
147 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
194 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
168 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  40.88 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
165 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  41.29 
 
 
180 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
167 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  42.48 
 
 
175 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.71 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  41.6 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
167 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
189 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
145 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
163 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
137 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
166 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  47.5 
 
 
139 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
134 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
145 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  42.86 
 
 
145 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
166 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
169 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
189 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.93 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
143 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
189 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
152 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  40.28 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40.32 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.86 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
152 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
164 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.86 
 
 
189 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.86 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  33.33 
 
 
167 aa  89.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>