More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2730 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  55.41 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  51.35 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  54.11 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  52.05 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  49.32 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  42.95 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  42.95 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  44.97 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  44.97 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  42.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  42.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  39.46 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  40.28 
 
 		 163 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 176 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  36.79 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.79 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  35.29 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 189 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  41.01 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.3 
 
 		 231 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  34.04 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.42 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.78 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 230 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>