More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2462 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  70.12 
 
 		 166 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  70.91 
 
 		 167 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  66.27 
 
 		 167 aa  224  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  63.91 
 
 		 169 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  62.13 
 
 		 168 aa  217  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  62.35 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  54.76 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  52.69 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  54.22 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  54.22 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  51.81 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  52.38 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  52.38 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  50.59 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  48.85 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  46.47 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  41.21 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 		 204 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  48.23 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  46.85 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  46.1 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  43.51 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  37.87 
 
 		 163 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  44.97 
 
 		 176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.55 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.72 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.56 
 
 		 231 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.91 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 181 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  43.05 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 181 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 		 143 aa  92  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 		 177 aa  91.3  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 142 aa  90.9  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  44.92 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.05 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  39.61 
 
 		 180 aa  87.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  40.28 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  41.01 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  39.42 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 148 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  35.53 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  35.53 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.57 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  42.2 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  37.09 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  35.38 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4589  hypothetical protein  75.51 
 
 		 67 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  32.54 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  30.36 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  28.49 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>