More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3241 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  76.22 
 
 		 167 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  70.12 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  63.47 
 
 		 167 aa  211  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  61.31 
 
 		 169 aa  207  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  62.13 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  59.52 
 
 		 168 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  55.15 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  52.38 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  50.3 
 
 		 172 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  54.22 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  50.9 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  50.9 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  46.86 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  46.86 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  46.2 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  47.53 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  47.88 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  46.06 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  48.67 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  41.14 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  47.26 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 		 189 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  45.58 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  37.13 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  43.92 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  37.11 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  42 
 
 		 175 aa  94.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  34.52 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.52 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  36.48 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.84 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 176 aa  90.5  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 218 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.42 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  39.57 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.36 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  30.57 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  39.34 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 164 aa  84  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 155 aa  84.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 		 177 aa  84  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.62 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.67 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  39.55 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  33.53 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.64 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>