More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4230 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
158 aa  206  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
105 aa  204  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  56.19 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
162 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  42.31 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  41.35 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
147 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  48.89 
 
 
166 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42.16 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 
185 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 
185 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  39.6 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  42.45 
 
 
231 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
148 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 
151 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
189 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
186 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
158 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  43.82 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
189 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  41.84 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  48.11 
 
 
180 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
184 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
145 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
158 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  45.54 
 
 
147 aa  84  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  45.54 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
189 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  44.79 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  44.57 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  41 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  53.93 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  46.88 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  41 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  48.98 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  49.06 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  43.82 
 
 
177 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
166 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  48.98 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 
173 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  54.65 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  47.19 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  41.76 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2335  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.62 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
204 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
173 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  41.24 
 
 
185 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.64 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  40.66 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  43.62 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.08 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3941  heat shock protein Hsp20  43.33 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>