More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0296 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  68.15 
 
 		 153 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  37.09 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 165 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  37.84 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  33.97 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 185 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 185 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 		 186 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  36.67 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 		 189 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  32.7 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  46.23 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36.81 
 
 		 189 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 		 189 aa  91.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.13 
 
 		 189 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.12 
 
 		 177 aa  90.9  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  36.36 
 
 		 198 aa  90.5  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.8 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 		 169 aa  88.2  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 		 147 aa  87.8  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  43.81 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 		 184 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  41.51 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  33.59 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  37.27 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  37.27 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 211 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  41.51 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  39.56 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  29.49 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  29.08 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>