More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0362 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  98.61 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 		 147 aa  195  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  58.5 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  60.45 
 
 		 148 aa  191  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  57.53 
 
 		 147 aa  190  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  56.38 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.55 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.59 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 		 177 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  34.81 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  41.94 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  32.12 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 189 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.97 
 
 		 189 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 		 189 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 158 aa  84.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  41.57 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  30.66 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.17 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 197 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.2 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  37.23 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.12 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  30.88 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.12 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  27.48 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>