More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2683 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
145 aa  294  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  61.38 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  61.38 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  52.03 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
152 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.67 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 
147 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.61 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  44.19 
 
 
151 aa  114  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.18 
 
 
144 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  44.19 
 
 
151 aa  114  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
146 aa  110  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  40.88 
 
 
189 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.9 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  41.22 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  41.55 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
148 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  42.14 
 
 
142 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 
148 aa  105  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
139 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
145 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
147 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
144 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 
145 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
146 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
146 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
143 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
145 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  40.15 
 
 
189 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 
189 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
145 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
189 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
148 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
189 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  34.85 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  46.9 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1166  heat shock protein Hsp20  56.79 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.380039  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  48 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  36.99 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
184 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
147 aa  96.7  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
163 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
150 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
204 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  44.44 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.53 
 
 
158 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  35.17 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.82 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
167 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  31.61 
 
 
218 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
173 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
158 aa  87.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  29.85 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  36.3 
 
 
149 aa  87  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
194 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
152 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.68 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>