More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2316 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
139 aa  277  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  73.19 
 
 
139 aa  217  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  80.58 
 
 
139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  71.22 
 
 
139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  67.63 
 
 
139 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  73.38 
 
 
139 aa  197  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  54.68 
 
 
134 aa  146  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  50 
 
 
132 aa  137  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 
134 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  49.24 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
132 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  53.49 
 
 
132 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  52.03 
 
 
132 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  45.13 
 
 
145 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
146 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
146 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  48.54 
 
 
147 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.72 
 
 
189 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
141 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  41.13 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  47.5 
 
 
142 aa  94  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  42.64 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  47.12 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.59 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  47.12 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
185 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
185 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  40.17 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
147 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  40.17 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.48 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  38.33 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.78 
 
 
144 aa  84.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  44.66 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
230 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
140 aa  83.6  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
140 aa  83.6  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
197 aa  83.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09080  molecular chaperone (small heat shock protein)  39.42 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.675828  normal  0.433955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  28.28 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  40.27 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  41.48 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  40.27 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42.02 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  41.49 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42.02 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
187 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 
211 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>