More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0557 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
147 aa  283  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  97.96 
 
 
147 aa  279  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  53.1 
 
 
142 aa  150  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  55.32 
 
 
142 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
194 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 
148 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  42.18 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 
189 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  43.28 
 
 
184 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 
189 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 
189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 
146 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  42.03 
 
 
189 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
189 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
145 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  40.56 
 
 
147 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  43.41 
 
 
153 aa  106  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  45.65 
 
 
145 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
145 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  43.17 
 
 
147 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
163 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
145 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  43.36 
 
 
153 aa  104  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
147 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
145 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
143 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  43.42 
 
 
175 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
176 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
169 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
144 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 
158 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
147 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
164 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  42.4 
 
 
149 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.61 
 
 
231 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  40 
 
 
146 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
146 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
147 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
156 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
164 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.97 
 
 
186 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.13 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.3 
 
 
185 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  39.33 
 
 
173 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  38.13 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
162 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
180 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  41.01 
 
 
171 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
172 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 
166 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
185 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
185 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  36.18 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.15 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  41.01 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  36.18 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
195 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  43.7 
 
 
148 aa  94  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
139 aa  93.2  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
147 aa  93.2  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.33 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.07 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 
144 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
150 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  41.27 
 
 
211 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>