More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0629 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  96.3 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  95.24 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  91.53 
 
 		 189 aa  362  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  90.48 
 
 		 189 aa  357  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  54.1 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  43.48 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  43.48 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  43.29 
 
 		 165 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  43.04 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  39.89 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  47.65 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  42.21 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  42.21 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  41.52 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  44.51 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 168 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 		 166 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  43.06 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  39.67 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  39.67 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38.27 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 176 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  40.25 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.3 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.51 
 
 		 231 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  39.24 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  45.37 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 175 aa  98.2  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 		 147 aa  97.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 		 148 aa  97.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 143 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 		 134 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  40.48 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.16 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 		 144 aa  95.5  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  37.78 
 
 		 173 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 		 145 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  38.12 
 
 		 158 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.67 
 
 		 143 aa  94.4  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 		 147 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 		 139 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 147 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 		 158 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 		 142 aa  92  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 		 150 aa  91.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 		 166 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  33.13 
 
 		 156 aa  90.9  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.21 
 
 		 144 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  29.12 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  36.3 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 142 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 149 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 144 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 145 aa  88.6  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  40.35 
 
 		 167 aa  88.2  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.56 
 
 		 151 aa  88.6  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.56 
 
 		 151 aa  88.6  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 142 aa  88.2  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.43 
 
 		 153 aa  88.2  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 147 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 147 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 		 105 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 134 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>