More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6390 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  98.93 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  80.75 
 
 		 187 aa  317  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  59.68 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  47.83 
 
 		 157 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.98 
 
 		 150 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  40.87 
 
 		 142 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  44 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 145 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 151 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  33.33 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 		 158 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 		 169 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 		 158 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 158 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  39.18 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 158 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.75 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.88 
 
 		 151 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.88 
 
 		 151 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 		 228 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 139 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  37.7 
 
 		 173 aa  84.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.91 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.69 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.05 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.71 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  38.1 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  27.4 
 
 		 139 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  32.37 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  31.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  34.07 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.45 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  43.04 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  37.14 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 		 142 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  31.86 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  32.46 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  36.61 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  36.61 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.9 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  26.21 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>