More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1806 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
139 aa  277  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  84.06 
 
 
140 aa  242  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  37.67 
 
 
513 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  39.67 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  37.24 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  37.24 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  37.24 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  37.39 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  37.24 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  37.24 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  37.24 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  38.21 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  40 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  36.07 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  35.9 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  33.93 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.73 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  36 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  29.6 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  39.05 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  31.62 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  26.98 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  39.36 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  32.86 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  36.7 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.94 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
177 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  34.38 
 
 
189 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  34.38 
 
 
189 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
163 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  34.62 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  34.21 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.97 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.3 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  39.13 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  29.31 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09080  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.61 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.675828  normal  0.433955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  29.6 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>