More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1219 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
140 aa  284  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
140 aa  284  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  70 
 
 
140 aa  214  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  67.14 
 
 
140 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  67.14 
 
 
140 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 
144 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  54.61 
 
 
142 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  51.05 
 
 
144 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  52.45 
 
 
513 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  50.35 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  50.35 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  50.35 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  49.65 
 
 
144 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  49.65 
 
 
144 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  49.65 
 
 
144 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  51.39 
 
 
145 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  49.29 
 
 
141 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  49.51 
 
 
142 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  48.54 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 
142 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  43.15 
 
 
142 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  47.12 
 
 
170 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
143 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  43.07 
 
 
149 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
145 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  48.45 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  38.1 
 
 
144 aa  87.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  44.76 
 
 
139 aa  87  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
147 aa  85.9  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
141 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  37.9 
 
 
141 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  43.69 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  43.56 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  39.37 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  43.3 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  43.43 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  39.58 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  35.65 
 
 
146 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  42.71 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008501  STER_B1  molecular chaperone (small heat shock protein)  34.92 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  38.28 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  42.16 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  41.41 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  38.46 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  35.58 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  36.59 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  35.77 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  36.59 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  36.59 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  35.77 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  41.24 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  36.59 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  36.59 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>