More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0200 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  88.57 
 
 		 140 aa  254  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  88.57 
 
 		 140 aa  254  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  70 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  70 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  51.05 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  52.45 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  55.32 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  52.45 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  52.45 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  52.45 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  52.45 
 
 		 513 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  51.75 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  51.75 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  51.75 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  51.43 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  43.28 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  41.55 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  43.84 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  42.95 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  45.65 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  43.22 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  36.49 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008501  STER_B1  molecular chaperone (small heat shock protein)  39.84 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  40.34 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  42.31 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.02 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  34.92 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  36.07 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  46.15 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  34.65 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  44.27 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  44.27 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.81 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  35.04 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.51 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  37.5 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  43.43 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  31.65 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.33 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 189 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.16 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  42.39 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  39.22 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  31.45 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>