More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3314 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  53.64 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  49.67 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  46.36 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  42.38 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 215 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  41.22 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  42.28 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  43.06 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  39.86 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  39.19 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  39.19 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  39.19 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  39.19 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  39.19 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  39.19 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  40.97 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  40.97 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  36.24 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  43.52 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  36.73 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.21 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 		 169 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  32.43 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.07 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  30.5 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  34.29 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  36.43 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  36.43 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  36.43 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  36.43 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  36.43 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  36.43 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  36.43 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  33.81 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  30.66 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>