More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3103 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  69.34 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  64.49 
 
 		 158 aa  186  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  64.75 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  66.94 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  58.45 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  60 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  59.12 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  53.03 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  46.38 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  43.66 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  47.2 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  44.62 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  52.04 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7013  hypothetical protein  61.9 
 
 		 253 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00663505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  34.72 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.53 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.01 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.76 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  31.31 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.31 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.47 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0514  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  37.78 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  28.67 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  36.46 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  36.46 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  35.29 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  27.07 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  34.86 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  25.98 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  37.08 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  31.72 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  34.62 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  32.14 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  29.51 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>