89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7013 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7013  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00663505  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  69.05 
 
 		 144 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  66.28 
 
 		 145 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  62.07 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  61.9 
 
 		 137 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  62.5 
 
 		 142 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  59.26 
 
 		 143 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  60.49 
 
 		 142 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  56.25 
 
 		 158 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  43.9 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  46.05 
 
 		 163 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  51.72 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  47.14 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  46.77 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  47.37 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  44.74 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  44.74 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  44.74 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  47.89 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  45.76 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  50.91 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  49.02 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  49.02 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  48.98 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  42.65 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  44.44 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 		 185 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  30.86 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2073  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00430311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 		 132 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  36.59 
 
 		 139 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  47.92 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0982  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.506219 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  42 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  47.5 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  33.72 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  34.29 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  32.99 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  34.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  34.85 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  34.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  34.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  34.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  40.32 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  42.62 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 169 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  34.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  34.85 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  44 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  29.37 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 		 142 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  34.85 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  34.85 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 		 158 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 		 150 aa  42.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.93 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 105 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 		 142 aa  42.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 		 139 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  33.72 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 		 148 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  29.27 
 
 		 144 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  30.26 
 
 		 340 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 		 132 aa  42  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  29.89 
 
 		 166 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.72 
 
 		 145 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 130 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>