More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3659 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
158 aa  313  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  64.49 
 
 
137 aa  186  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  69.01 
 
 
143 aa  186  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  63.38 
 
 
140 aa  173  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  65.12 
 
 
142 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  65.15 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  61.94 
 
 
142 aa  157  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  59.42 
 
 
145 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  51.09 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  49.25 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  48.09 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  51.18 
 
 
163 aa  121  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  48.59 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  47.73 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  44.29 
 
 
150 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  43.57 
 
 
148 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
144 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7013  hypothetical protein  56.25 
 
 
253 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00663505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
138 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  31.06 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  29.92 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.8 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  33.57 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  29.92 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.38 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.38 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  30.77 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  44.19 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0514  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  32.77 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  30.65 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  27.54 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  42.22 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  31.65 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  39.77 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  30.07 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  32.32 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  37 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  35.71 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  28.79 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  39.08 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  29.71 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  30.13 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.88 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2525  putative small heat shock protein  32.17 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.586363  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.71 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  39.08 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>