More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1743 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  53.79 
 
 
135 aa  150  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  52.34 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  41.74 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  43.97 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  42.37 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  37.38 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  37.31 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
135 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  37.21 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  43.52 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  35.9 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
195 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  39.81 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  39.81 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  39.13 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  39.13 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  39.13 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  39.13 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  39.13 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  39.13 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.44 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
147 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  38.6 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  40.78 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  40.78 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  40.78 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  40.78 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  40.78 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  40.78 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  40.78 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  37.5 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  40 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.05 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  37.04 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  35.59 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  34.26 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.88 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  41.49 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.85 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>