More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0720 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
120 aa  245  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  48.76 
 
 
122 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  46.9 
 
 
121 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  49.52 
 
 
143 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  43.86 
 
 
122 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 
117 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  47.17 
 
 
134 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
139 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
185 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
195 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  35.83 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.33 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  35.24 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  36.61 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  32.23 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  34.29 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  33.01 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  33.01 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  33.01 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  33.01 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  33.01 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  33.01 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  31.73 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  34.29 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  34.29 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  32.35 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.78 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  28.69 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.48 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  27.5 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  37.11 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  31 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.52 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  37.84 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  29.57 
 
 
513 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  28.97 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  30.77 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  32.14 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  30.39 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  30.39 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>