More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1174 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
134 aa  93.2  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
122 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
120 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
143 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  40.74 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  40.74 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  37.84 
 
 
127 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  37.8 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  35.88 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  35.88 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  35.88 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  38.46 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  35.88 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  35.88 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  37.5 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  35.88 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  44.04 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  39.05 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.27 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  39.6 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  39.6 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  39.6 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  39.6 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  39.6 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  39.6 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  39.6 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  31.93 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  35.59 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  40.2 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  34.17 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.43 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  36 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.19 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  33.98 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.19 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.64 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  32.46 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  27.19 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  34.65 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  33.65 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  34.29 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>