More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2959 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  72.55 
 
 
117 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  69.61 
 
 
121 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  52.63 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  49.52 
 
 
120 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  43.66 
 
 
134 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
134 aa  95.9  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  36.53 
 
 
185 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  43.81 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
139 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  35 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  35 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
139 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  37.29 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  39.25 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  34.43 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  35.58 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  38.24 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  30.07 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  38.24 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  38.24 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  38.24 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  38.24 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  38.24 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  38.24 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  33.07 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  33.07 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  33.07 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  33.07 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.1 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  36.89 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  33.07 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  33.07 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  34.51 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.58 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.58 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.65 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.53 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  34.95 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.4 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  40.19 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  38.46 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>