More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3774 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  99.24 
 
 
132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  77.27 
 
 
132 aa  221  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  75.76 
 
 
132 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  63.64 
 
 
132 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  47.29 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
135 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  42.31 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  43.44 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.59 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  39.52 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  34.11 
 
 
127 aa  76.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  36.51 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  32.08 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.1 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  34.31 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.5 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  34.58 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  37.74 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  37.74 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  37.74 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  34.58 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  34.58 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  37.74 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  37.74 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  34.58 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  34.58 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  37.74 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  34.58 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  37.74 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.4 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  40.7 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  37.04 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  37.04 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  30.89 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  33.05 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.96 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  36.79 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  36.79 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  36.79 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  36.79 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  36.79 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>