More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0179 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  62.16 
 
 
149 aa  196  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  59.59 
 
 
156 aa  193  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  59.46 
 
 
149 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  59.46 
 
 
149 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  59.46 
 
 
149 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  61.49 
 
 
149 aa  188  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  55.78 
 
 
147 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  51.33 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  51.88 
 
 
168 aa  156  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 
147 aa  140  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  45.65 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  48.94 
 
 
143 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  47.89 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  48.48 
 
 
144 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
137 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
142 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 
165 aa  120  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  47.73 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
143 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
144 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  36.43 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35.06 
 
 
161 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  41.59 
 
 
158 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  40.2 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  40.2 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  32.24 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
146 aa  87  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
146 aa  87  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.1 
 
 
147 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
137 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.51 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  44.44 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.89 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  38.98 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  40.16 
 
 
149 aa  76.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  35.85 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  35.85 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  35.85 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  35.85 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  35.85 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  26.76 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  35.85 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  35.85 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  35.85 
 
 
513 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  32.06 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  34.33 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.78 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  33.64 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2411  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2458  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>