More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3600 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 165 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  48.98 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  50.32 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  53.03 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  44.67 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  51.09 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  43.98 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  51.43 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  50.36 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  47.71 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  55.81 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  42.95 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  35.57 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  52.04 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  49.51 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.21 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  30.56 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  30.56 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  36.28 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  30.56 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.38 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.39 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.33 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  27.46 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  30.72 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  30.72 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  30.87 
 
 		 513 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  28.81 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  30.72 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  30.5 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  32.86 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  35.35 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  27.64 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  34.17 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  38.71 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  32.35 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  26.76 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  29.92 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  26.47 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  25.35 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  27.63 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.28 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  32.84 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  36.78 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7013  hypothetical protein  45.07 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00663505  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  25.74 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  25.69 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>