More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4235 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  69.01 
 
 
158 aa  186  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  65.25 
 
 
140 aa  181  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  66.94 
 
 
137 aa  175  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  63.85 
 
 
142 aa  170  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  61.07 
 
 
144 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  61.07 
 
 
145 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  60.9 
 
 
142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  49.63 
 
 
156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  48.94 
 
 
149 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  48.84 
 
 
168 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  55.81 
 
 
165 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  53.08 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  47.92 
 
 
143 aa  117  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 
149 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
149 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
144 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  48.51 
 
 
129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  44.78 
 
 
147 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  43.07 
 
 
148 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
150 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  43.61 
 
 
149 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  43.61 
 
 
149 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  43.61 
 
 
149 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7013  hypothetical protein  59.26 
 
 
253 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00663505  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  42.59 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  37.04 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0514  heat shock protein Hsp20  41.86 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  30.82 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  30.23 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  31.3 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.42 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  31.25 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.42 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.59 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.08 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  31.3 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  30.33 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  34.51 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  32.82 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  35.19 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  36.61 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  36.61 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.94 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  31.53 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>